鄂尔多斯市公安局管辖7个旗区公安（分）局和康巴什公安分局、东胜公安分局、成吉思汗陵治安分局、交通运输治安分局和空港物流园区分局等5个直属分局。 

　　内设办公室、情报指挥中心（市预警应急指挥中心） 、督察审计信访支队、经济犯罪侦查支队、治安管理支队、刑事侦查支队（鄂尔多斯市公安司法鉴定中心） 、反恐怖和特警支队、生态环境食品药品犯罪侦查支队（市森林公安局）、监所看护管理支队、网络安全保卫支队、出入境管理支队（国际警务合作支队）、警务保障支队、交通管理支队、法制支队（执法办案管理中心）、禁毒支队（市禁毒委员会办公室） 、科技信息化支队（科技信息化委员会办公室）、警务航空支队（鄂尔多斯飞行队）、政治部、机关党委(党建工作办公室) 。